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Automation in accession classification of Brazilian Capsicum germplasm through artificial neural networks Scientia Agricola
Ferreira,Mariane Gonçalves; Azevedo,Alcinei Mistico; Siman,Luhan Isaac; da Silva,Gustavo Henrique; Carneiro,Clebson dos Santos; Alves,Flávia Maria; Delazari,Fábio Teixeira; da Silva,Derly José Henriques; Nick,Carlos.
ABSTRACT Germplasm classification by species requires specific knowledge on/of the culture of interest. Therefore, efforts aimed at automation of this process are necessary for the efficient management of collections. Automation of germplasm classification through artificial neural networks may be a viable and less laborious strategy. The aims of this study were to verify the classification potential of Capsicum accessions regarding/ the species based on morphological descriptors and artificial neural networks, and to establish the most important descriptors and the best network architecture for this purpose. Five hundred and sixty-four plants from 47 Brazilian Capsicum accessions were evaluated. Neural networks of multilayer perceptron type were used in...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Garson’s method; Artificial intelligence; Taxonomy; Germplasm bank.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162017000300203
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Biochemical descriptors: importance of the genetic divergence study in peppers Horticultura Brasileira
Araújo,Lourismar M; Neves,Leonarda G; Sousa,Demétrio A; Zeviani,Walmes M; Silva,Lucinéia da R; Marostega,Thalita N.
ABSTRACT The genetic diversity of pepper genotypes is usually evaluated based on morphological and molecular descriptors. However, studies using biochemical descriptors of peppers are still incipient. Thus, the objective of this study was identify biochemical descriptors of Capsicum spp. with antioxidant action, most responsive to the selection of superior genotypes, and evaluate the correlation between concentrations of the parameters using principal components analysis. The experiment was conducted in the city of Cáceres, southwest Mato Grosso, Brazil. Seventy-eight pepper accessions from the Active Germplasm Bank of UNEMAT were planted in randomized block design. The harvested fruits were immersed in liquid nitrogen for two minutes, and the following...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Main components; Genetic variability.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362019000200210
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Caracterização morfológica e classificação da superfície foliar de pimentas quanto à presença de tricomas e domácias Horticultura Brasileira
Matos,Cláudia Helena C; Pallini,Angelo; Pinto,Cleide Maria F; Venzon,Madelaine; Rezende,Daniela DM; Freitas,Rita Cristina P de.
O conhecimento das características morfológicas das plantas é de grande relevância para o estudo das interações entre plantas, herbívoros e inimigos naturais. Variações nessas características são determinantes na ocorrência, abundância e diversidade de organismos que exploram esse habitat. Caracterizou-se a superfície foliar de quatro espécies de pimentas do gênero Capsicum e elaborou-se uma proposta de classificação das folhas com base nos critérios de presença ou ausência, densidade e distribuição de tricomas para domácias, visando a utilização dessas informações em estudos de resistência de plantas a artrópodes. A contagem dos tricomas foi feita em uma área de 5 cm²,no terço médio das folhas, sendo contabilizados os tricomas do limbo, das nervuras e das...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Densidade de tricomas; Domácia; Defesa de plantas.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362011000200008
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Characterization of pepper accessions using molecular markers linked to pungency and SSR Horticultura Brasileira
Jesus,Rafaela de; Santos,Gabriel do N; Piccin,Andressa S; Balsalobre,Thiago WA; Sala,Fernando C; Carneiro,Monalisa S.
ABSTRACT Peppers of the genus Capsicum are of great socioeconomic importance, being pungency trait their main attraction. Pungency characterization, genetic distance estimates and population structure analysis of the accessions belonging to germplasm banks are important for parent selection which allows to obtain superior progenies. Therefore, the aims of this study were: i) evaluate 81 accessions of the Capsicum spp. Germplasm Bank of Universidade Federal de São Carlos (BGC-UFSCar) with molecular markers linked to pungency; ii) estimate the genetic diversity among accessions of the BGC-UFSCar using microsatellite markers (SSR); and iii) evaluate the efficiency of these markers in the distinction among species of Capsicum spp. We noticed that pun11 and SNP...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; SSR; Germplasm; Dissimilarity; Polimorphism.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362019000200152
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Combinations of distance measures and clustering algorithms in pepper germplasm characterization Horticultura Brasileira
Gomes,Gisely Paula; Baba,Viviane Yumi; Santos,Odair P dos; Sudré,Cláudia P; Bento,Cintia dos S; Rodrigues,Rosana; Gonçalves,Leandro SA.
ABSTRACT Characterization and evaluation of genotypes conserved in the germplasm banks have become of great importance due to gradual loss of genetic variability and search for more adapted and productive genotypes. This can be obtained through several ways, generating quantitative and qualitative data. Joint analysis of those variables may be considered a strategy for an accurate germplasm characterization. In this study we aimed to evaluate different clustering techniques for characterization and evaluation of Capsicum spp. accessions using combinations of specific measures for quantitative and qualitative variables. A collection of 56 Capsicum spp. accessions was characterized based on 25 morphoagronomic descriptors. Six quantitative distances were used...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Multivariate analysis; Clustering methods; Genetic diversity; Qualitative and quantitative descriptors.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362019000200172
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Dissimilaridade genética entre acessos de pimenta com potencial ornamental Horticultura Brasileira
Neitzke,Raquel Silviana; Barbieri,Rosa Lía; Rodrigues,Walter F; Corrêa,Inez V; Carvalho,Fernando IF de.
Alguns tipos de pimentas do gênero Capsicum são utilizados como plantas ornamentais, por possuírem caracteres, que conferem valor estético, por serem de fácil cultivo e apresentarem grande durabilidade. Entretanto, no Brasil são poucas as variedades comerciais destinadas a este propósito. O presente trabalho teve por objetivo caracterizar e estudar a distância genética dos acessos com potencial ornamental do Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum da Embrapa Clima Temperado. O experimento foi realizado de julho de 2007 a fevereiro de 2008, no campo experimental da Embrapa Clima Temperado, em blocos ao acaso, com três repetições, utilizando 17 acessos, com dez plantas por parcela. As plantas foram caracterizadas morfologicamente com oito descritores...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Banco ativo de germoplasma; Caracterização morfológica; Descritores quantitativos; Descritores qualitativos.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362010000100009
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Divergência genética entre acessos de pimenta e pimentão utilizando técnicas multivariadas Horticultura Brasileira
Sudré,Cláudia P.; Rodrigues,Rosana; Riva,Elaine M.; Karasawa,Mina; Amaral Júnior,Antônio T. do.
Técnicas multivariadas foram utilizadas para avaliar a divergência genética entre 56 acessos da coleção de germoplasma de Capsicum spp. da UENF. Foram utilizados onze descritores quantitativos propostos pelo International Plant Genetic Resources Institute, em um experimento conduzido em condições de campo, em Campos dos Goytacazes (RJ), no delineamento de blocos ao acaso com três repetições e 10 plantas por parcela. A distância generalizada de Mahalanobis (D²) foi utilizada como medida de dissimilaridade. Foram aplicadas variáveis canônicas, método hierárquico do vizinho mais próximo, método de otimização de Tocher e projeção das distâncias no plano. As variáveis avaliadas foram comprimento e diâmetro do fruto, número de sementes por fruto, peso médio do...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Germoplasma; Variáveis canônicas; Método de Tocher; Projeção das distâncias no plano; Recursos genéticos.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362005000100005
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Evaluation of production and quality traits in interspecific hybrids of ornamental pepper Horticultura Brasileira
Nascimento,Naysa Flávia F do; Rêgo,Elizanilda R do; Nascimento,Mayana F; Bruckner,Cláudio H; Finger,Fernando L; Rêgo,Mailson M do.
ABSTRACT The cultivation of potted peppers as ornamental plants has increased considerably throughout the planet. In Brazil, this crop is more recent and still lacks cultivars. In order to increase the available variability and obtain new cultivars, the interspecific hybridization is very useful in add a desirable attribute that occurs in one species to another species, resulting in a new cultivar of agronomic interest. The objective of this study was to characterize parents and interspecific hybrids based on 27 quantitative traits and evaluate their genetic diversity by multivariate procedures. Parents of seven pepper genotypes were crossed, and, seven hybrids were generated. The experiment was conducted in a completely randomized design. Data were...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Hybridization; Relative importance; Breeding; Characterization.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362019000300315
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Fenotipagem e seleção de genitores em acessos de pimentas para fins ornamentais Horticultura Brasileira
Silva,Camila Q; Jasmim,Janie M; Santos,Jardel O; Bento,Cíntia S; Sudré,Cláudia P; Rodrigues,Rosana.
O crescimento do mercado das pimentas para fins ornamentais no Brasil demanda cultivares adaptadas às condições ambientais brasileiras. Este trabalho teve como objetivos caracterizar 22 acessos de Capsicum spp. considerando-se 13 descritores qualitativos e oito quantitativos relacionados ao potencial ornamental; estimar a dissimilaridade entre os acessos, a contribuição relativa dos caracteres avaliados e indicar genitores para cruzamentos em programas de melhoramento para fins ornamentais. O experimento foi conduzido em casa de vegetação, em blocos ao acaso com três repetições e quatro plantas por parcelas. Onze grupos foram formados pelo método UPGMA para as características qualitativas e oito para as quantitativas. Na análise conjunta dos dados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Caracterização morfológica; Descritores; Recursos genéticos; Banco de germoplasma..
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362015000100066
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Marcadores RAPD e caracteres morfoagronômicos na determinação da diversidade genética entre acessos de pimentas e pimentões Ciência Rural
Costa,Fabiane Rabelo da; Pereira,Telma Nair Santana; Sudré,Cláudia Pombo; Rodrigues,Rosana.
A diversidade genética existente em coleções e bancos de germoplasma pode ser estimada por meio de diversos métodos, sendo que a escolha destes depende da disponibilidade dos recursos e da precisão desejada pelo pesquisador. Neste trabalho, marcadores RAPD e caracteres morfoagronômicos foram usados para estimar a divergência genética entre 52 acessos de Capsicum spp. Um total de 57 variáveis binárias geradas pela caracterização morfoagronômica e 84 bandas polimórficas obtidas a partir da análise por RAPD foram analisadas separadamente e em conjunto, permitindo a construção de três dendrogramas. Observou-se a formação de dois grupos principais, tanto na análise morfoagronômica e molecular separadamente, quanto na análise conjunta dos dados. O agrupamento...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Germoplasma; Marcadores moleculares; Descritores qualitativos.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000300011
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Microsatellites for detecting inconsistencies in Capsicum cultivars registration in Brazilian database: more than meets the eye Horticultura Brasileira
Azevedo,Carlos Diego de O; Rodrigues,Rosana; Sudré,Cláudia P.
ABSTRACT In Brazil, cultivars are registered by National Register of Cultivars (RNC), which besides enabling commercialization of cultivar propagative material, also guarantees the producers genetic purity and identity of propagules. However, it is possible that the information about registration and commercialization of some cultivars is inaccurate. This study aims to analyze the use of microsatellite markers to detect inconsistencies in data of Capsicum spp. cultivars obtained from the official database (CultivarWeb). Seven cultivars were evaluated, three of them were through genetic identity analysis (Amarela Comprida, De Cayenne and Cayenne Long Slin) and the others were used as standard for the species C. annuum, C. frutescens and C. chinense....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Microsatellites; Registered cultivars.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362019000300285
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New resistance sources to root-knot nematode in Capsicum pepper Horticultura Brasileira
Pinheiro,Jadir B; Silva,Giovani Olegario da; Macêdo,Amanda G; Biscaia,Danielle; Ragassi,Carlos Francisco; Ribeiro,Cláudia SC; Carvalho,Sabrina Isabel C de; Reifschneider,Francisco José B.
ABSTRACT Thirty seven pepper genotypes, Capsicum chinense, C. annuum and C. frutescens, were characterized for resistance to three root-knot nematode species (Meloidogyne javanica, M. incognita race 1 and M. enterolobii) aiming to find potential resistance sources to be used in breeding programs. Three experiments were carried out, in 2013, 2014 and 2016, in a greenhouse, in randomized block design and six replicates, one plant/pot. Data were submitted to analysis of variance and average clustering. All evaluated pepper genotypes were resistant or immune to M. javanica. For M. incognita race 1, all accessions of C. frutescens, evaluated in the first experiment, were resistant, whereas the six accessions of C. chinense were susceptible. For M. incognita,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Meloidogyne javanica; M. incognita race 1; M. enterolobii.
Ano: 2020 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362020000100033
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Nuevos Hospederos Alternativos de Begomovirus asociados con el Cultivo de Ají en el Valle del Cauca, Colombia Acta Agron. (Palmira)
Vaca-Vaca,Juan Carlos; Corredor-Saenz,Viviana C.; Jara-Tejada,Frenyiline; Betancourt-Andrade,Dyanela; Lopez-Lopez,Karina.
Resumen Los begomovirus (virus de plantas de DNA de cadena sencilla) son la principal amenaza para los cultivos en áreas subtropicales y tropicales. Existen varios estudios que muestran cómo evolucionan por mecanismos de intercambio genético, que ocurren en hospedantes alternativos, entre ellos las malezas o arvenses. Estas se encuentran ampliamente distribuidas y tienen una alta adaptabilidad al ambiente. El objetivo de este trabajo fue identificar nuevos hospederos alternos de begomovirus en malezas asociadas con cultivos de ají (Capsicum sp.) que crecen en el Valle del Cauca, Colombia. Para el estudio fueron recolectadas malezas con y sin síntomas virales alrededor de estos cultivos ubicados en los municipios de Zarzal, Vijes, Toro, Unión, Roldanillo y...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ají; Arvenses; Begomovirus; Capsicum spp.; Bemisia tabaci.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122019000100056
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Pimentas ornamentais: aceitação e preferências do público consumidor Horticultura Brasileira
Neitzke,Raquel S; Fischer,Síntia Z; Vasconcelos,Carla S; Barbieri,Rosa L; Treptow,Rosa O.
RESUMO: O mercado de pimentas ornamentais no Brasil tem boa perspectiva de crescimento. Porém, apesar de haver ampla variabilidade genética disponível nos bancos de germoplasma no país para o desenvolvimento de novas cultivares, há poucas cultivares comerciais. O conhecimento das necessidades e preferências dos consumidores aumenta as chances de sucesso para novas cultivares. Este trabalho teve como objetivo avaliar a aceitação e as preferências do consumidor em relação a pimentas ornamentais do Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum da Embrapa Clima Temperado. Dezessete acessos de pimentas ornamentais cultivadas em vasos foram submetidos à avaliação de aceitação e preferência dos consumidores. Foram aplicadas entrevistas individuais semi-estruturadas para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Acessos; Variabilidade; Melhoramento vegetal; Valor ornamental..
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362016000100102
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Potencial ornamental de acessos de pimenta Ciência Rural
Melo,Leane Fialho de; Gomes,Regina Lucia Ferreira; Silva,Verônica Brito da; Monteiro,Eliane Rodrigues; Lopes,Ângela Celis Almeida; Peron,Ana Paula.
O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial ornamental de dez acessos de pimenta Capsicum spp. procedentes da Coleção de Germoplasma da Universidade Federal do Piauí, Brasil. O experimento foi conduzido em casa de vegetação, no Departamento de Fitotecnia, do Centro de Ciências Agrárias, no município de Teresina, Piauí, obedecendo ao delineamento experimental inteiramente casualizado, com três repetições. Na caracterização morfoagronômica dos acessos, conforme orientação do Bioversity International, utilizaram-se os seguintes descritores qualitativos e quantitativos para o gênero Capsicum: forma da folha, hábito de crescimento da planta, antocianina no nó da planta, posição da flor, cor da corola, cor do fruto no estado intermediário e maduro, forma...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Descritores morfoagronômicos; Coleção de germoplasma..
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014001102010
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Reação de acessos de pimentão e pimentas ao oídio (Oidiopsis taurica) Horticultura Brasileira
Blat,Sally F.; Costa,Cyro Paulino da; Vencovsky,Roland; Sala,Fernando César.
O oídio causado pelo fungo Oidiopsis taurica é uma das principais doenças no gênero Capsicum spp. Seus danos podem causar desfolha de até 75% e perdas de até 40% em produção. Seu controle através de fungicidas tem se mostrado ineficaz, sendo a resistência genética a melhor alternativa. Poucas fontes de resistência já foram identificadas em Capsicum annuum. Neste trabalho avaliou-se os acessos da coleção de Capsicum spp. do banco de germoplasma da USP/ESALQ quanto às suas reações ao oídio e identificar novas fontes de resistência. O experimento foi conduzido em casa de vegetação em condições severas de ocorrência do patógeno. Durante a fase de frutificação foi feita a avaliação das reações, através de uma escala de notas, de 1 (resistente) a 5 (altamente...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Leveillula taurica (Lev.) Arn; Resistência genética.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362005000100015
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Resistência de pimentas a nematóides de galha e compatibilidade enxerto/porta-enxerto entre híbridos de pimentão e pimentas Horticultura Brasileira
Oliveira,Cristina Duda de; Braz,Leila T; Santos,Jaime M dos; Banzatto,David Ariovaldo; Oliveira,Paulo Roberto de.
Avaliou-se a resistência à Meloidogyne incognita e a compatibilidade de enxertia de treze porta-enxertos de pimenta (nove Capsicum chinense; três C. annuum e um C. frutescens) quando enxertados com os híbridos de pimentão-vermelho Rubia R, Margarita e Maximos. O experimento foi conduzido em 2005 na UNESP-FCAV em Jaboticabal-SP. As plantas foram enxertadas por garfagem do tipo fenda simples e, 25 dias após foram avaliadas quanto à percentagem de "pegamento" e, posteriormente, juntamente com plantas sem enxertia, foram transplantadas em casa de vegetação e inoculadas, individualmente, com 5.000 ovos e juvenis de segundo estádio de M. incognita. A avaliação da resistência dos porta-enxertos ao nematóide foi feita aos 181 dias após a inoculação, com base no...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Meloidogyne spp.; Enxertia; Cultivo protegido.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362009000400019
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Sources of resistance against the Pepper yellow mosaic virus in chili pepper Horticultura Brasileira
Bento,Cíntia dos S; Rodrigues,Rosana; Zerbini Júnior,Francisco Murilo; Sudré,Cláudia P.
The Pepper yellow mosaic virus (PepYMV) naturally infects chili and sweet pepper, as well as tomato plants in Brazil, leading to severe losses. This work reports the reaction to the PepYMV of 127 Capsicum spp. accessions, aiming at identifying resistance sources useful in breeding programs. The experiment was carried out in a completely randomized design, with eight replications, in greenhouse conditions. Plants were protected with an insect-proof screen to avoid virus dissemination by aphids. Leaves of Nicotiana debneyi infected with the PepYMV were used as the inoculum source. Plants were inoculated with three to four fully expanded leaves. A second inoculation was done 48 hours later to avoid escapes. Only the youngest fully expanded leaf was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; Pepper yellow mosaic virus; Potyvirus; Germplasm evaluation; Disease resistance; Pre-breeding.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362009000200013
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Validação de marcadores moleculares associados à pungência em pimenta Horticultura Brasileira
Pereira,Ítalo S; Barreto,Fernanda Z; Balsalobre,Thiago WA; Sala,Fernando C; Costa,Cyro P; Carneiro,Monalisa S.
A pungência em frutos de pimenta do gênero Capsicum, devido à presença de capsaicinóides, é uma das características mais atrativas e muito valorizadas pela culinária mundial. Neste trabalho, objetivou-se validar e avaliar a eficiência de predição dos marcadores moleculares pun1¹, pun1³ e o SNP identificado pelo método tetra-primer ARMS-PCR para a determinação de pungência em acessos de Capsicum spp. Trinta e seis acessos do Banco de Germoplasma da Universidade Federal de São Carlos foram avaliados através de análises sensoriais (em frutos maduros) e moleculares para pungência (na fase de plântula através da extração do DNA em folhas). Os marcadores SNP ARMS-PCR, pun1¹ e pun1³ foram usados na avaliação molecular. Os resultados mostram a eficiência desses...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Capsicum spp.; SNP; Melhoramento genético; Seleção..
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362015000200009
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